A caixa infectada é um contêiner raro com conteúdo valioso. Você tem uma pequena chance de obtê-la em um local especial cujas coordenadas estão indicadas em um disquete.
Você pode obter disquetes com coordenadas no primeiro andar da casamata ao aumentar o nível de reputação do seu especialista, preenchendo a barra dele em troca de plaquetas de identificação, divisas e cadernetas militares. Você pode obter esses itens no modo difícil ativando o protocolo na casamata.
Você também pode obter disquetes no modo normal. Você obtém um disquete em um determinado nível de reputação em troca do excesso de cupons verdes, amarelos e vermelhos com o oficial na mesma sala.
Quando você obtiver o disquete com coordenadas, insira-o no terminal na sala do supervisor no primeiro andar da Casamata Alfa. Depois disso, um local temporário aparecerá no mapa global. Lá você pode encontrar uma caixa infectada com espólios de qualidade: armas, armaduras, recursos raros e componentes. O conteúdo da caixa infectada pode mudar dependendo do seu nível de reputação com o supervisor. Ao aumentar sua reputação, você aumenta sua chance de obter uma recompensa mais rara.
Vale ressaltar que, na maioria dos casos, o local conterá uma caixa militar comum com recursos. No entanto, às vezes, uma caixa infectada aparece em vez dela. Você não pode abrir uma caixa como essa instantaneamente — ela precisa ser levada para a base e limpa no banho de ácido. Para levar a caixa infectada para a base, você precisa chegar ao local nas coordenadas de motocicleta e colocá-la no baú. Ao retornar à base, você precisa colocar a caixa no banho de ácido. Você também precisa instalar um filtro de ar no banho e adicionar ácido, o que dará início ao processo de limpeza. Você só poderá abrir a caixa e pegar suas recompensas após a conclusão da limpeza.